影响肠道菌群的主要因素有4个方面：人体自身的因素(肠道的酸碱性，胆汁及消化酶的分泌，肠道的蠕动，肠道黏液的分泌，肠道表皮的脱离等)以及人所处的环境因素(压力，出差等); 人体摄入的饮食(可消化的食物与不可消化的纤维、药物等); 细菌自身因素(细菌的黏附能力，繁殖能力，营养需求量，抗消化酶能力等); 细菌之间的相互作用(营养竞争，相互克制作用，协同作用等)。

  肠道菌群处于健康的平衡状态(大肠内的益生菌数量是有害菌的1千倍到1万倍)，致病菌或者条件致病菌以很少的数目存在，它们产生的有毒代谢物不足以对宿主的健康产生危害。但当上述所说的4个方面的因素急剧变化，肠道内有益菌数量大量减少，有害菌数量疯狂增长，肠道菌群平衡被打破，人体就会出现腹泻、等症状。肠道菌群平衡被打破，结果就是健康的受损。

  所以，为了保证肠道日常正常运作，除了在日常生活中合理饮食，正常作息外，还有补充足够的益生元，增殖肠道有益菌，让肠道保持健康。调查数据显示，人体人均日常实际益生元入量为2-8g/d，距离人体日常所需至少摄入量-15g还有一定差距。所以，一般人要保证肠道每日所需益生元，则需要额外补充。